NUPI har i sitt arbeid med risikostyring satt fokus på følgende risikofaktorer i forhold til gjeldende mål for instituttet:
Denne listen gjengir en prioritert rekkefølge av disse ut fra en funksjon av sannsynlighet for at faktoren kan oppstå og konsekvensen av denne.
Tap av omdømme, inntekter og kompetanse er forhold som henger tett sammen og som alle vil ha innvirkning på NUPIs styringsparametere. Instituttet kan vanskelig leve lenge med betydelige tap for de nevnte forhold, men er innstilt på å kunne håndtere mindre variasjoner i inntektssammensetningen og en turnover i staben på et normalt nivå.
I 2009 har instituttet lagt vekt på styrking av instituttets omdømme, blant annet gjennom programmet for markering av NUPIs 50 års jubileum. NUPI har også styrket sin kapasitet på prosjektoppfølging og rapportering for å kunne imøtekomme krav fra ulike finansieringskilder.
På inntektssiden har instituttet hatt fokus på å styrke inntjening fra ulike kilder og samtidig arbeidet med tilpasning til det indikatorbaserte finansieringssystemet for basisbevilgning. Dette arbeidet fortsetter inn i 2010.
Kompetanseutvikling og oppfølging av NUPIs stab er en kontinuerlig prosess ved instituttet. I siste halvår av 2009 er det blant annet igangsatt arbeid med en egen personalstrategi, som vil bli sluttbehandlet våren 2010.